hola,
a ver si me podíes orientar un poco... 

es unos días muy probablemente reserve para ir con la furgo en ferry de Dinamarca a Noruega y veo que se peude escoger vehículo de menos de 5m de longitud y hasta 2m de altura.

Tengo una renault trafic con una claraboya típica, que sube la altura un poquito  ¿ me arriesgo y escojo esta opción de vehículo?

No sabria que decirte.
Mi experiencia es de un viaje a Islandia en Ferry.
Con la vaca y el cofre superaba la altura permitida ( segun billete ), asi que lo desmonté todo, lo metí como pude dentro de la furgo y sopresa, no miraron nada.
Al entrar me pusieron al lado de unas AC, que superan la altura de la furgo en medio metro o mas.

Yo pasé en Ferry el año pasado. Lo de la altura es por que los parkings de los ferry tienen varias alturas, y los más altos entran los últimos y se quedan en la zona con más espacio. Supongo que no irá al milímetro, pero ojo.

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En la zona donde te ponen en el ferry no tendras problemas. Pero en los giros para subir de planta en plante del ferry la cosa se ajusta y de echo se suelen ver marcas. No creo que tengas problemas. Pero anda con mil ojos al subir. Yo personalmente me arriesgaba. Salvo que sea poca la diferencia de precio

Otra opción es quitar la cúpula de la claraboya y luego la vuelves a poner