Fallo al colocar claraboya, se estanca el agua en el techo y filtra.

[Miserjo]

En las grandes superficies de construcción,venden unos perfiles de aluminio y de PVC en "L" de distintas medidas.
Yo metería debajo de ese lateral un perfil de esos y rellenaria bien de butilo,o de polímero.
Así te aseguras que solo podría entrar agua entre la unión entre el techo y ese perfil, pues aunque quedara un poro en la parte alta del perfil, difícilmente va a entrar agua a 3cmm.
Vamos es una idea

[Phoenixtoledo]

Pues podrías rellenarlo con trozos de cinta de butilo apilados uno encima de otro hasta completar la altura, o cordon de butilo, y luego sellar con un Sika 521UV por fuera.

[Damaker+]

Con algo tendrás que rellenar, lo de colocar algún tipo de perfil me parece adecuado pues deja menos lugar a dudas después, más un buen sellado.
Ahora con temperaturas bajas asegurate de tener el butilo o polímero etc a una temperatura óptima de aplicación y si el techo está templado de estar al sol o en cubierto pegará todo mejor, si usas cartucho puedes meterlo previamente en un cubo con agua caliente por ejemplo.

Saludos y ya nos cuentas 💪